Если драконы - просто звери, то Моргот подавляет их волю и управляет. Он это и с разумными мог делать, а уж со зверями - тем более.
Драконы разумные создания, а не просто звери, разумеется.
И даже
всем подряд "просто зверям" мелькор не мог приказывать, будучи еще могучим невоплощенным айну. Животное паучиное потомство (разумной) Унголианты не служило Мелькору и не собиралось. Никаких самостоятельных мумаков не замечено, все под управлением махаутов. Ни "изначально злых" животных, вроде пауков или ядовитых змей, ни "зомбированных" Мелькором. Вот эльфы - те видимо да, умели заставить животных служить себе: Келегорм знал языки зверей и птиц Средиземья, или Беорн с пони, которые за гранью дрессуры
У "злых" были правда некие волколаки - волки-оборотни, которые как и оборотни-летучие мыши, происходят от майар и являются "творением Моргота". Ну или "порождением" Моргота, если "творение" неудобное слово в этом контексте. Но все таки это не животные: они понимают язык эльфов и сами общаются между собой на черной речи.
Если драконы - майяр, то они служат Морготу, соответственно, ему подчиняются.
Предпосылки, объективные причины?
Одно дело могучий Мелькор до рассеяния, от простого взгляда которого трепещут прочие валар, другое Мелькор-Моргот - в конце 1й эпохи, к моменту создания летающих драконов, который был "менее эффективен, чем Саурон во 2ю эпоху" (ПЭ, текст "Заметки по мотивам Сильмариллиона"). Воплощенный Мелькор познал страх, он никогда не выходил наружу из Ангбанда - кроме того самого случая, когда его и напугали так, уколов несколько раз булавкой в ногу. Боялся физической смерти.
Если предположить, что драконы (а также майар, орки и прочая) слушались его только потому что он их создатель - это нелогично. Эльфы и люди не слушаются Эру, что об орках говорить. Если драконы подчинялись Мелькору по праву сильного - тут я сильно сомневаюсь. Если сильмариль причил боль ладошке Черного Врага, то уж пламя дракона, способное расплавить Кольцо Саурона, например, сожгёт его насмерть. Да даже откусит ему зверюга (пусть и вполне разумная) руку: конец его, моргота, кузнечным опытам.
Опятьжетелепатия - это неплохо, но какая разница, телепат или ртом сказал, если балрог или дракон стал уже сильнее чем Моргот, и может занять его место? Почему не занял? Саурон, стал который "более эффективен, чем Мелькор к концу 1й эпохи" мог бы убить господина и занять его место. Однако это не происходит.
Выходит, или уважение к патриарху/лидеру-вдохновителю, или что-то такое, что еще не было упомянуто.